Ce programme est destiné à favoriser le développement des I.F.R. autour des objectifs suivants :

• Fédérer des unités de recherche relevant de différents partenaires institutionnels autour d'une stratégie scientifique commune d'excellence, en complémentarité avec les autres modalités de structuration ;
• Elaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les unités de recherche afin de renforcer la visibilité de l'activité de recherche et de favoriser l'animation scientifique et la formation ;
• Permettre une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels pour développer des projets scientifiques fédérateurs ;
• Etablir des relations avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement de partenariats économiques et sociaux.

Il existe, au 1er janvier 2009, 77 IFR (consulter la liste).  

Le Comité de pilotage

Le comité de pilotage a la responsabilité d'une réflexion stratégique, émet un avis sur la création et le renouvellement des I.F.R. et arrête l'attribution des subventions sur la base des évaluations faites par l'Agence d'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur (AERES). Le comité de pilotage est composé de représentants du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche (Direction Générale de la Recherche et    et de l'Innovation et Direction Générale de l'Enseignement Supérieur), du Ministère en charge de la Santé, de représentants de la Conférence des Présidents d'Université et d'un représentant de chacun des autres partenaires institutionnels : C.N.R.S., Inserm, INRA, I.R.D., C.E.A.. La présidence du comité est assurée par le Directeur de la Direction Générale de la Recherche et de l'Innovation ou son représentant.

L'appel d'offres à création ou à renouvellement des IFR 

Un appel d'offres pour création ou renouvellement des IFR, ainsi que pour leur soutien financier, a lieu chaque année. Les projets sont examinés par le conseil scientifique du programme I.F.R. en se fondant sur le rapport d'expertise d'un comité de visite du site formé d'experts extérieurs désignés par l'Agence d'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur. Ce comité de visite peut être accompagné d'observateurs désignés par les partenaires.

Les projets sont évalués spar l'AERES uivant les critères ci-dessous :

•  pertinence du projet de stratégie scientifique résultant de la fédération des unités constituantes (cohérence et synergie du regroupement des unités, augmentation de la visibilité et de la qualité internationale de la recherche du site) ;
• dynamique de la fédération des unités, prévision d'accueil de nouvelles équipes et d'émergence de jeunes équipes sur le site ;
• présence et projet d'équipements communs indispensables aux unités constituantes (plateaux techniques, plates-formes technologiques ouvertes à l'extérieur) ;
• projet d'animation scientifique, résultant spécifiquement de la fédération des unités constituantes (visibilité régionale, nationale, européenne, internationale) ;
• implication spécifique de la fédération des unités constituantes dans des projets et des actions de formation à et par la recherche (masters, écoles doctorales, accueil de post-doctorants) ;
•  implication résultant spécifiquement de la fédération des unités constituantes dans la valorisation des résultats de la recherche et, s'il y a lieu, contribution à la création d'activités ou de laboratoires de transfert ;
• mutualisation effective des moyens des unités constituantes (budget et personnel) affectés aux services communs et à l'animation scientifique ;
• adéquation des moyens existants et envisagés (personnels, équipements, locaux, fonctionnement) avec le projet fédératif ;
• compétences du Directeur proposé pour assurer la direction scientifique et porter le projet fédératif.
  

Après évaluation, les projets de création ou de renouvellement d'I.F.R. sont soumis au comité de pilotage pour avis final. La création ou le renouvellement pour 4 ans des IFR sélectionnés intervient au 1er janvier de l'année de contractualisation des établissements d'enseignement supérieur du site géographique dans lequel se trouve l'II.F.R. Les I.F.R. ne sont officiellement créés ou renouvelés qu'après la signature de la convention-cadre par les partenaires institutionnels de l'I.F.R.

Une enveloppe budgétaire est fixée chaque année par l'ensemble des partenaires pour le soutien de ce programme. Le montant de la subvention allouée à chaque IFR est défini par le comité de pilotage en accord avec l'Université dont dépend l'UFR.

L'enveloppe budgétaire du programme I.F.R. est abondée notamment par :

• des crédits de la recherche universitaire dans le cadre de la contractualisation quadriennale des universités ;
• des crédits des E.P.S.T. et EPIC partenaires ;
• des crédits du programme hospitalier de recherche clinique du Ministère en charge de la Santé.

Ces subventions sont destinées à toute opération nécessaire à la politique scientifique de l'I.F.R.