Dix étudiants français et dix étudiants québécois sont ainsi sélectionnés chaque année et bénéficient d'une aide financière pour leur déplacement et leur séjour au Québec, soit 3 mois de bourse et 1 billet d'avion par an pendant 3 ans au maximum.

Ce soutien n'est pas cumulable avec celui octroyé par le programme Lavoisier ou par toute autre aide à la mobilité susceptible d'être octroyée par des départements ministériels, des organismes de recherche, des universités et des entreprises français.

Pour pouvoir bénéficier de la bourse de soutien à la mobilité pour cotutelle de thèse franco-québécoise, les procédures diffèrent selon l'origine et le lieu de résidence du candidat :

Pour les étudiants québécois : l'appel à candidatures est lancé par le Gouvernement du Québec, au mois de juin. La date limite de dépôt des dossiers est généralement en octobre.
Pour les étudiants français : en 2007, l'appel à candidatures est lancé par le Consulat général de France à Québec. Cet appel se substitue, pour ce qui le concerne, à celui lancé jusqu'en 2006 par le Ministère français délégué à l'Enseignement supérieur et à la Recherche dans lequel il s'inscrivait.