Infrastructures de recherche : Sciences du système terre et Environnement

European Multi-environment Plant pHenomics And Simulation InfraStructure-EMPHASIS-FR

Emphasis

EMPHASIS-France développe des plateformes de phénotypage de plantes en conditions contrôlées et au champ, des systèmes d'imagerie, des capteurs en réseaux, des méthodes d'analyse de données, un système d'information, pour caractériser la variabilité génétique des réponses au changement climatique.

Article - 19.02.2016

Présentation

Emphasis-France a pour objectif de fournir les infrastructures nécessaires à l'analyse de la variabilité génétique des réponses des plantes aux stress environnementaux associés aux changements climatiques:

- Plateformes de phénotypage pour des milliers de plantes/parcelles, avec une définition temporelle allant de minutes à jours, ainsi que des capteurs de l'environnement ressenti par les plantes:

  • Plateformes robotisées équipées d'outils d'imagerie en conditions contrôlées, permettant des analyses architecturales et fonctionnelles,
  • Champs intensément instrumentés pour l'analyse de peuplement de plantes soumis à des situations artificialisées (enrichissement de l'air en CO2, sécheresse contrôlée) équipés de moyens intensifs d'imagerie du couvert
  • Réseaux de champs équipés de capteurs et de moyens mobiles d'imagerie dans des conditions climatiques contrastées.

- Système distribué d'information conçu pour acquérir, organiser et stocker les données générées dans l'ensemble de l'infrastructure et pour échanger les données, en relation avec d'autres infrastructures.

- Outils d'analyse en termes (i) d'évaluation haut débit de la qualité des millions de points de données, (ii) d'analyses statistiques de données temporelles associées à des milliers d'individus.

- Outils de modélisation des plantes, capables d'extrapoler les données acquises dans des dizaines de scénarios climatiques européens à partir de paramètres recueillis sur les plateformes de phénotypage.

Mots clés

Phenotypage, changement climatique, température, sécheresse, génétique, imagerie, capteurs, champ, serre

Données

Estimation des flux de données 

100 To/an

Stockage

2-3 Po en 2020

Accessibilité 

Minutes à semaines suivant les jeux de données

Appartenance à des réseaux 

France Grille, EU Grids

1ère publication : 19.02.2016 - Mise à jour : 5.04.2016
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  • Type de l'infrastructure : IR
  • Localisation (coordination) : Montpellier
  • Autres sites : IR distribuée
  • Partenaires : INRA, Arvalis Institut du Végétal, CEA, CNRS, Terres Inovia
  • Responsable de l'infrastructure : François Tardieu

Dates Clés

Création : 2012

Exploitation : 2013

Site Internet

Contact   

Dimension internationale

EMPHASIS, ESFRI Roadmap

Coordinateur de l'infrastructure : Uli Schurr, DE

Pays partenaires : DE, FR, UK, BE

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