L'université bénéficie également d'opérations immobilières de grande ampleur grâce au contrat de projet Etat-région avec un financement de 58 millions d'euros (Etat et collectivités) sur la période 2007-2013.
L'université bénéficie en 2009 d'une augmentation inédite de ses moyens de fonctionnement et d'investissement.
En 2009, les crédits de l'université progressent de manière exceptionnelle grâce au nouveau modèle d'allocation des moyens, au plan licence, au chantier carrières et au bonus contractuel.
Les crédits d'investissement, hors ceux réservés aux opérations CAMPUS et CPER, augmentent également de façon significative en 2009.
Il permet d'accélérer les opérations du contrat de projet Etat-région (CPER). Des moyens sont notamment prévus pour :
- les travaux de modernisation de la bibliothèque du campus du Moulin de la Housse (coût de l'opération 2,8 M€ dont 2 M€ pris en charge par l'Etat) et la poursuite des travaux de restructuration du bâtiment 7 du campus Moulin de la Housse (2ème tranche) ;
- le lancement de l'opération de reconstruction de l'unité de formation et de recherche (UFR) droit, sciences politiques et économiques du campus Croix Rouge (coût de l'opération 25 M€ dont 11,7 M€ financés par l'Etat).