Infrastructures de recherche : Biologie et Santé

Institut Français de Bioinformatique-IFB

IFB© ©JFGibrat

L'IFB est une infrastructure de recherche distribuée en  bioinformatique qui fournit des données (informations biologiques ), des outils, une infrastructure informatique dédiée, des formations et un appui aux projets de recherche pour la communauté des sciences de la vie.

Article - 10.02.2016

Présentation

L'IFB est une infrastructure nationale de service en bioinformatique. Sa mission principale est de fournir des ressources de base dans ce domaine à la communauté des sciences du vivant. Les différents services offerts par les plates-formes de l'IFB sont décrits sur le site web de l‘infrastructure, mais peuvent être regroupés en 5 grandes catégories :

  • Les données : mise à disposition de collections de données avec une grande valeur ajoutée issue de l'expertise des laboratoires
  • Les outils : diffusion d'outils innovants pour analyser les données biologiques produites en laboratoire
  • L'infrastructure : fournir une infrastructure informatique dédiée à la gestion et analyse des données produites par les sciences du vivant. Cela implique non seulement le matériel (CPU, stockage, mémoire, réseau), mais aussi l'accès aux collections de données publiques et aux très nombreux outils utilisés en biologie. Cette infrastructure sera mise à disposition prochainement sous la forme d'un Cloud académique.
  • La formation des utilisateurs aux techniques et concepts de la bioinformatique
  • L'appui aux projets de recherche des biologistes en matière d'analyses bioinformatiques

L'IFB est constituée de 34 plates-formes regroupées en 6 pôles régionaux et un nœud national, l'IFB-core, qui est une Unité Mixte de Service dépendante du CNRS, CEA, INRA, INRIA, INSERM.

Mots clés

Analyses NGS, bioinformatique structurale, annotation de génomes, phylogénie, génomique comparative, bases de données spécialisées, intégration de données, interopérabilité des services, infrastructure IT, Cloud

Données

Estimation des flux de données 

Plusieurs Po de données/an

Stockage

2 Po de stockage sur disque et 2 Po de stockage sur bande, celles des PF régionales fournissent 5 Po de stockage.

Accessibilité 

IFB  gère les données dans les meilleures conditions de sécurité et d'accès.

Appartenance à des réseaux 

L'IFB fait partie d'ELIXIR qui est une infrastructure européenne de bioinformatique distribuée.

1ère publication : 10.02.2016 - Mise à jour : 5.04.2016
IFB logo
  • Type de l'infrastructure : IR
  • Localisation (siège) : Gif-sur-Yvette
  • Autres sites : Distribuée : 34 sites regroupés en 6 pôles régionaux et un nœud national
  • Partenaires : CNRS, CEA, INRA, INRIA, INSERM.
  • Responsable de l'infrastructure : Jean-François Gibrat

Dates Clés

Création : 2013

Exploitation : 2014

Site Internet

Contact   

Dimension internationale

IFB est le nœud français de ELIXIR, ESFRI Landmark

Coordinateur de l'infrastructure : Niklas Blomberg

Pays partenaires : BE, DK, EMBL-EBI, EE, ES, FI, FR, IL, NO, NL, PT, CZ, UK, SE, CH

Site internet

Les recherches les plus fréquentes :

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