Publié le 13.05.2026

PEPR SolsVivants : comprendre les interactions dans les sols pour agir

Lancé le 19 avril dernier, le Programme et équipements prioritaires de recherche (PEPR) SolsVivants s'intéresse à la santé des sols et mobilise la recherche fondamentale en écologie et sciences du sol.

Programme de recherche SolsVivants : étudier l'écosystème des sols
Les sols abritent des millions d’espèces (micro-organismes et nombreux invertébrés). Ces micro-organismes, en interaction avec la faune du sol et les plantes, sont capables d'agir sur les sols.
Ils peuvent aider les sols à :

  • recycler les nutriments,
  • stocker l’eau et le carbone,
  • résister aux perturbations (sécheresses, inondations...).

Toutefois, les écosystèmes des sols sont fragilisés. Afin de mieux comprendre le fonctionnement des sols, le programme de recherche (PEPR) SolsVivants vient d'être lancé. 

Les objectifs du programme :

  • étudier le rôle des organismes du sol,
  • développer des solutions pour préserver leur biodiversité,
  • former une nouvelle génération de chercheurs.

Qu’est-ce que la « santé des sols » ?

Les sols et toute la vie qu’ils hébergent sont essentiels à notre quotidien : ils produisent notre nourriture, filtrent l’eau, stockent le carbone et contribuent à la régulation du climat. Ils sont pourtant fragilisés par certaines pratiques humaines et le changement climatique.

Le PEPR SolsVivants vise à mieux comprendre le rôle des organismes (micro-organismes, faune du sol, plantes, etc.) dans le bon fonctionnement des sols, afin de préserver ces fonctions essentielles et de mieux anticiper leur évolution.

La santé des sols correspond à leur capacité à fonctionner durablement comme un écosystème vivant, permettant ainsi de : 

  • soutenir la production végétale,
  • maintenir une biodiversité riche,
  • recycler les nutriments,
  • réguler l’eau et le climat.

Un sol en bonne santé est donc un sol qui présente des organismes vivants, qui est également structuré et résilient face aux perturbations.
Toutefois, la santé des sols peut être dégradée par plusieurs facteurs, souvent combinés : 

  • artificialisation et érosion des sols,
  • pratiques agricoles intensives (travail du sol, intrants),
  • pollution (métaux, pesticides),
  • changement climatique,
  • perte de biodiversité.

Ces pressions affectent les organismes du sol et les interactions biologiques qui sont au cœur de leur fonctionnement.

Les enjeux du PEPR SolsVivants

Le PEPR SolsVivants est un programme de recherche fondamentale et intégrative qui a pour but de produire des connaissances solides sur le fonctionnement des sols ainsi que les rôles que joue la biodiversité dans ce dernier.

INRAE et le CNRS en assurent le pilotage scientifique et coordonnent les organismes de recherche, les établissements universitaires et d’ingénieur et l'institut technique agricole partenaires.

Le programme doit contribuer à la structuration et au renforcement de la communauté française des sciences du sol, en soutenant des approches de recherche innovantes et interdisciplinaires à l’interface des sciences du vivant (écologie, agroécologie) et de l’environnement.

9 M€ de budget sur 5 ans financé dans le cadre du plan France 2030

48unités de recherche impliquées dans le programme

27partenaires

Le PEPR SolsVivants permettra également de consolider les capacités nationales de recherche (notamment par le recrutement de doctorants et de post-doctorants), participant ainsi à la formation d’une nouvelle génération de scientifiques spécialisés dans l’étude du fonctionnement biologique et écologique des sols.

Mieux comprendre les interactions et le fonctionnement des sols

Ver de terre en forêt de l’Escandorgue (Hérault)
Crédits :
Philippe Hinsinger

Ver de terre en forêt de l’Escandorgue (Hérault)

Le programme de recherche a identifié deux projets ciblés qui visent à mieux comprendre comment les organismes du sol interagissent entre eux et comment ces interactions influencent le fonctionnement des sols.

Les sols sont un pilier discret mais essentiel de nos sociétés. En comprenant mieux la biodiversité qui les habite et les mécanismes qui les font fonctionner, nous nous donnons les moyens de préserver leur capacité à produire, réguler et s’adapter aux changements globaux. 

Jérôme Mathieu, enseignant-chercheur Sorbonne Université / iEES-Paris / CNRS, co-directeur du PEPR SolsVivants
  • Le premier projet ciblé concerne les réseaux d’interactions dans les sols, c’est-à-dire l’ensemble des relations entre organismes (micro-organismes, faune du sol, plantes), incluant les interactions trophiques (relations alimentaires comme prédation, herbivorie ou détritivorie) et les interactions non trophiques (facilitation, compétition, modification de l’habitat par les organismes ingénieurs du sol). L’objectif est de caractériser la structure de ces réseaux et d’identifier les interactions clés qui régulent les communautés du sol.
  • Le second projet ciblé s’intéresse à l’impact de ces interactions biotiques sur la multifonctionnalité des sols, c’est-à-dire la capacité des sols à assurer simultanément plusieurs fonctions écosystémiques. Il met l'accent sur deux ensembles :
  1. la structuration du sol et les processus de transfert d’eau, de solutés ou de particules de sol qui en découlent, d’une part,
  2. les transformations impliquées dans les cycles biogéochimiques du carbone, de l’azote, du phosphore et d’autres nutriments, d’autre part.

Le programme vise à mesurer comment les interactions entre organismes du sol influencent ces fonctions, et à déterminer dans quelle mesure la diversité et l’organisation des communautés biologiques contribuent au maintien ou à la dégradation des services écosystémiques associés.

Complémentarité avec d'autres programmes de recherche

Le PEPR SolsVivants s’inscrit en complémentarité avec plusieurs programmes dont :

  • le PEPR FairCarboN qui aborde le cycle du carbone dans les écosystèmes continentaux ;
  • le PEPR FORESTT qui se concentre sur l’adaptation des forêts aux changements climatiques ;
  • le PEPR SOLUBIOD qui s’appuie en partie sur les sols et leurs fonctions pour proposer des solutions d’adaptation durable face aux changements globaux ;
  • le PEPR Dynabiod qui vise à documenter et comprendre les dynamiques de la biodiversité, y compris celle de la faune du sol.

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